深入虎穴
蜂巢的兵力由于上次婚礼的偷袭而大减，考虑到蜂巢的安全，女王不同意主动出兵攻打WD蜂的老巢——下水道，一气之下，旦旦计划与屎壳郎大叔一起潜入并摸清下水道，可却被小花背偷听到，在小花背的威逼之下，他们只好答应小花背的要求。
进入下水道后，屎壳郎大叔引开了门卫——螳螂兄弟，而旦旦和小花背发现了在寝室睡觉的WD蜂，小花背执意想在此时杀死WD蜂，替细腰姐和独臂大婶报仇，旦旦扭不过她，同意了她的看法。
旦旦潜入寝室，想抓住WD蜂时，WD蜂却抓住了守在门口的小花背，关上寝室的门，把旦旦困在里面并想用烟熏死旦旦……
蜜里逃生第15集剧情介绍甘当人质
危机之下，制服完螳螂兄弟的屎壳郎大叔，救出了困在寝室中的旦旦并逃了出去，而小花背却受到了WD蜂、鼓眼睛的虐待，回到蜂巢后的旦旦非常懊悔，蓝蓝知道旦旦勇敢，但靠单个蜜蜂的力量，却是很小的，旦旦焕然大悟。
WD蜂和鼓眼睛感叹他们命运的悲哀，WD蜂随口说出想当人的想法，鼓眼睛却知道变成人的办法——抽喝人类的血，WD蜂便以小花背为借口，要旦旦与他见一面，众蜜蜂决定暗中保护旦旦。
WD蜂却知道旦旦耍花招，要旦旦命令众蜜蜂走开，并和他走一趟，再次来到下水道的旦旦，看见小花背后，大嚷着要WD蜂和鼓眼睛放开小花背，WD蜂趁机打晕了旦旦，拿起针筒，抽起了旦旦的血……
蜜里逃生第16集剧情介绍变成旦旦
WD蜂成功变成了旦旦，把真旦旦和小花背困在下水道后，假旦旦便出发前往旦旦家，假旦旦回家使爸爸妈妈大为高兴，为了庆祝旦旦回家，爸爸妈妈做了很多旦旦喜爱的饭菜，还帮旦旦过前几天没过的生日，但旦旦(WD蜂)的行为却有些异常。
于是，爸爸决定明天带旦旦去医院检查，当晚，爸爸和旦旦聊了有关WD蜂的话题，因为WD蜂的性格残暴，会危害其他蜂巢里的蜜蜂，所以爸爸早已决定停止研究WD蜂这个实验，并把剩余的幼虫卵全都进行冰冻处理，还表示若能找回WD蜂，就要把它做成标本，假旦旦(WD蜂)听后，便晕了过去。
第二天早上，屎壳郎大叔在下水道找到了真旦旦和小花背，把他们救了出来，真旦旦回家找假旦旦并阻止要他，小花背和屎壳郎大叔回蜂巢求助，而假旦旦趁爸爸还没睡醒，偷偷拿走了实验室的钥匙，前往实验室……
蜜里逃生第17集剧情介绍粉碎阴谋
假旦旦从爸爸试验室找到WD蜂幼虫虫卵，真旦旦上前阻止，真假旦旦一场生死斗，爸爸赶到便挽救了局面，抢回了虫卵，无奈之下，假旦旦说出了事情的真相，也抱怨爸爸为什么要培育出这么孤僻、生性残暴的自己，并要挟爸爸把虫卵交出来，刚好众人前来帮忙。
假旦旦趁乱刺伤爸爸并逃走，掉进了下水道里，真旦旦看见后，认为WD蜂已经被淹死，便回到蜂巢向众蜜蜂报告，原想帮助旦旦消灭WD蜂的众蜜蜂听到之后很高兴，也决定晚上要为旦旦举行欢送会。
殊不知，WD蜂原本就是喝下水道里的水存活的，回到老巢后，再次结合黑蚂蚁、花金龟和鼓眼睛准备火攻蜜蜂王国……
蜜里逃生第18集剧情介绍(大结局)火烧蜂巢
蜜蜂王国为了欢送旦旦回家而举行欢送会，WD蜂在森林找到烟头，趁众蜜蜂看蓝蓝为旦旦吐蜜时，将烟头扛到蜂巢门口，瞬间燃起通天大火，旦旦在校参加过火灾逃生演习，与众蜜蜂分工合作。
一部分先与女王、幼虫宝宝逃生，另一部分便阻止大火的蔓延，蓝蓝和大尾叫旦旦先离开，可旦旦承认自己是一只蜜蜂，必须保护好蜂巢与蜂巢内蜜蜂们的安全，与大火作战到底，女王也因为挂念其他小蜜蜂的安危而迟迟守在天梯口，天梯坍塌，女王、旦旦等众蜜蜂被困在大火之中，旦旦最后想到搭蜂梯，把女王先运出去。
不料却受到鼓眼睛和WD蜂的阻挠，鼓眼睛最后被旦旦一剑刺死，WD蜂也被拉进熊熊大火之中，女王最终获救，此时蜂巢坍塌，其他蜜蜂们舍身救了旦旦，逃出蜂巢后的旦旦遇到了浮在水面上蓝蓝。
蓝蓝说女王等蜜蜂们已经没事了，她回来找旦旦，却因为体力不支掉在水上，临死前表达了对人类生命的希望，蓝蓝吐完最后的一口蜜后，便沉入水中，旦旦悲怆扑向溪流。
恢复成人，旦旦悲痛万分，感慨道蜜蜂们的生命虽然如此短暂，但却能酿出最香甜的蜂蜜奉献给人类，旦旦望着广阔的蓝天，回想起变成蜜蜂后的点点滴滴，走向远方的城市……
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