宋智勇迫于全国“清网行动”的舆论力量，再次给城东所老丁打来电话。孙志军拒绝按照老丁的安排，和不负责任抛下自己的父亲对话。
老丁在说服宋智勇投案自首后，说服孙志军见到了29年没见过面的父亲。宋智勇悔恨交加，安心等待司法机关的处理。孙志军和鲁民四处寻找有大额现金的单位准备作案。
《水落石出第五部/水落石出5》第22集剧情介绍吴颖要与许毅离婚。许毅一怒之下答应去办手续，却发现吴颖身患重病，一切无理取闹都是为了以后不成为许毅事业和生活的累赘……
许毅开始反思自己丈夫角色的缺失。高林从省厅借来测谎仪，准备对黄冠进行测谎。
孙志军因为儿子上学急需一笔钱而告诉鲁民，自己之所以最初要嫁祸于许毅，是因为许毅的父亲29年前举报了自己的父亲，使自己没能有一个很好的成长环境。现在，他要弥补这一缺憾，要为自己的后半生和儿子“大干一票”。
《水落石出第五部/水落石出5》第23集剧情介绍重案队对黄冠进行测谎，结果黄冠被排除了杀害朱一鸣的嫌疑。许毅经过侦查，得知朱一鸣之死的真相是贩枪团伙所为。
原来，朱一鸣失业后被狱友勾结，答应帮忙贩卖枪支，但慑于 “清网行动”所造成的舆论态势，明白违法的后果而产生反悔之心。
贩枪团伙为了保密，将其杀之灭口。网上贩枪的 “泥鳅”就是现实生活中的 “春哥”。
重案队成功将“泥鳅”抓捕，不仅侦破了朱一鸣死亡案，而且还掌握了 “泥鳅”上线的情报。
孙志军和鲁民在准备动手时，发现原来踩好点的单位已经加强了戒备，只好暂时罢手。“泥鳅”被抓后，女儿被贩卖幼儿的犯罪团伙拐走。
《水落石出第五部/水落石出5》第24集剧情介绍重案队全力以赴，及时侦破了幼儿被拐案，解救了“泥鳅”的女儿，解除了后顾之忧的“泥鳅”答应和警方合作，诱捕潜藏在大西北某省市的特大贩枪团伙。
许毅和最不像警察的老丁隐藏真实身份，在重案队的暗中护送下，通过“泥鳅”的介绍，卧底潜入西北贩枪团伙洽谈业务，他们打消了贩枪团伙的怀疑，双方相谈甚欢。一个微小的细节导致许毅身份暴露，但许毅自己还不知道。
《水落石出第五部/水落石出5》第25集剧情介绍老丁为了示警，提前行动，牺牲在贩枪团伙的枪下，贩枪团伙武力对抗抓捕。在当地公安的全力配合下，许毅和其他重案队员将贩枪团伙一网打尽。
孙志军和鲁民对一家金店下手，他们的种种伪装行为被重案队所掌握，因为急需用钱，孙志军和鲁民不得不找到地下收金的人去销赃。
对方安排人假冒警察黑吃黑吓得孙志军和鲁民扔下黄金逃走。许毅和重案队顺藤摸瓜，从地下销赃渠道得知鲁民不是参与者也是知情者，当夜就布置抓捕并突审。
《水落石出第五部/水落石出5》第26集剧情介绍(大结局)绝望的鲁民供出了孙志军是“709”案的作案人。孙志军侥幸逃脱了重案队的抓捕。重案队一路追逃，他们向局领导保证，“清网行动”的目的就是不让犯罪嫌疑人逃脱法律的制裁，重案队也有决心不让新案件的嫌疑人逃脱法网。
在一个杳无人烟的村庄，许毅发现了孙志军的踪迹。孙志军开枪拒捕，经过一番战斗后，许毅生擒了孙志军，胜利凯旋。 (剧终)
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