有人认为，麦田圈只是一种自然现象，成因还未被人类发现。就像雷电，古时候人类也是以为是雷神电母做的。对于麦田圈中经常出现人文信息的现象，他们认为这只是人们“先入为主”造成的错觉。
但是，什么样的自然现象能够产生这样华美的花纹?更多的人认为，麦田怪圈的背后，是一群外星人在秘密操纵，麦田怪圈是外星人留给我们的信号。
意大利都灵出现了不可思议的麦田怪圈，这与2002年出现在Crabwood镇的麦田怪圈有相似的讯息，而这讯息是一种对人类的警告。这两个麦田怪圈都包含了二进制码(binaryocode)，内圈里有更多的代码但目前还无法被破解。
这两个麦田怪圈都有相同的警告，那就是要小心外星人，这与史蒂芬霍金的担忧相同。霍金说过：“外星人会被他们可以取得与控制的能量给限制，比我们能够想像的还要多。这些高等外星人可能会成为游牧民族，找寻可以统治与殖民的星球，我能够想像他们具有巨大的宇宙飞船，以消耗掉他们星球的能量。假如他们来拜访我们的话，我想结果会跟哥伦布刚抵达美国时一样，对印地安人来说不是一件好事。”
Crabwood麦田怪圈的二进制码翻译成英文的话会是:小心带来假礼物与假承诺的人。许多痛苦但还有时间。相信。还是有善良在外面。我们反对欺骗。管道结束。
这是拉丁文，看起来是罗马名诗人Virgil的诗Aeneid里的段落。第一个字是"timeo"意思是"惧怕"，第二个字是"et"拉丁文意思是"与"，但在现代白话文的意思是"外星人"，第三个字"ferentes"拉丁文意思是"带来"。Virgil诗里的句子是"TimeoDanaosetdonaferentes"或"小心带来礼物的希腊人。"这是在讲木马屠城记的故事，希腊人用假礼物欺骗特洛伊人然后進入特洛伊把他们打败。
WhitleyStrieber的书里"解答交流之谜(SolvingtheCommunionEnigma)"说到好心与坏心的外星人可能都会把他们在我们世界里的存在保密，因为各有不一样的原因。
坏心的外星人可能会因为某种我们不瞭解的原因利用我们或我们的星球，但假如我们这么做的话他们会反对，所以他们会把他们的行动保密。
好心的外星人可能会有一样的动机，他们会担心假如我们知道他们的科技有多先進，会吓到我们，造成我们自己的科技与文化革命受到干扰。我们会从我们世界的主人变成他们的随从。对他们来说我们最有趣的地方就是我们的创意，而这一切都会不见。
这两个麦田圈给我们的是一种警告，所以我们应该考虑高等生命会想如何利用我们。首先是我们可能有对他们有价值的东西，而那藏在我们里面最靠近知识的东西就是我们的灵魂，而它可以被捕捉被高等生命用在我们无法想像的东西里面。另一个是他们可能利用我们的繁殖功能来帮助他们。第三个是地球上有他们想要得到而我们想要保留的东西。
好心与坏心的外星人唯一有可能出现在我们面前的原因会是一样的原因，那就是假如我们面临绝种，他们会想要保存人类或地球让他不要灭亡。
但他们用的方式会很不一样。好心的外星人想要保存我们的文化会用最少直接与我们接触的方式来帮助我们活下去。而坏心的外星人不在乎我们的文化，只想保存我们的生命，可能会用更极端的方式進行。
所谓的外星人说也只是麦田怪圈的猜想之一，也有一些人认为它确实是自然的产物，是在及其复杂的环境下产生的大自然的杰作。
龙卷风说，从有关记载来看，麦田怪圈出现最多的季节是在夏天，有人认为，夏季天气变化无常，龙卷风是造成怪圈的主要原因。很多麦田怪圈出现在山边或离山六七公里的地方，这种地方很容易形成龙卷风。也有气象学家提出：大量尘埃包含在陆地上生成的小型龙卷风中，在风的作用下，尘埃与空气剧烈摩擦产生静电荷。神秘怪圈就是在带有静电荷的小型龙卷风的作用下产生的。
磁场说，有专家认为，磁场中有一种神奇的移动力，可产生一股电流，使农作物“平躺”在地面上。美国专家杰弗里·威尔逊研究了130多个麦田怪圈，发现90%的怪圈附近都有连接高压电线的变压器，方圆270米内都有一个水池。由于接受灌溉，麦田底部的土壤释放出的离子会产生负电，与高压电线相连的变压器则产生正电，负电和正电碰撞后会产生电磁能，从而击倒小麦形成怪圈。
预告说，一些人相信，麦田怪圈背后有种神秘的力量，就像百慕大三角一样。根据这种猜测，有人认为麦田怪圈是“灾难预告”。
麦田怪圈(Crop circle)是在麦田或其他农田上，透过某种力量把农作物压平而产生出几何图案。此现象在20世纪70年代才开始引起公众注意。目前，有众多麦田圈事件被他人或者自己揭发为有人故意制造出来以取乐或者招揽游客。唯麦田圈中的作物“平顺倒塌”方式以及植物茎节点的烧焦痕迹并不是人力压平所能做到，也有麻省理工学院学生试图用自制设备反向复制此一现象但依然未能达成，至今仍然没有解释该现象是何种设备或做法能够达到。此点也是支持外星人存在论的主要物证基础。
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